Chociaż wodę w wannie z hydromasażem często uzdatnia się środkami dezynfekującymi, takimi jak chlor lub brom, aby zahamować rozwój bakterii i grzybów, środki te nie są panaceum, a substancje chemiczne i mikroorganizmy w wodzie mogą nadal mieć wpływ na zdrowie użytkownika.

Gdy twardość wody w zewnętrznej wannie jacuzzi jest zbyt wysoka, najczęstszym problemem jest gromadzenie się kamienia. Aby zmniejszyć tworzenie się kamienia, można zastosować następujące metody: ● Używaj zmiękczacza wody ● Stosuj stabilizator jakości wody ● Regularnie czyść układ obiegu wody

W większości wanien spa z hydromasażem wkład filtrujący jest zwykle umieszczony blisko powierzchni wody, osadzony pod zbiornikiem filtra lub pokrywą filtra. Ta pozycja umożliwia filtrowi bezpośredni kontakt z powierzchnią wody i szybkie usuwanie pływających zanieczyszczeń.